히비스서커스의 블로그

TCGA dataset은 주로 genomic dataset으로 알려져 있으나 WSI 데이터도 존재한다. 최근 GDC Data Portal에서 TCGA-CRC (TCGA-COAD와 TCGA-ROAD) 를 다운로드 받으면서 필요한 각 스텝을 정리하였다. 기본적으로 GDC manifest라는 다운로드 받을 목록이 적힌 파일을 다운로드 받고 이를 gdc-client라는 다운로드 코드로 GDC manifest 목록들을 다운로드 방식이다.  1. GDC Data Portal에 접속 https://portal.gdc.cancer.gov/ https://portal.gdc.cancer.gov/ portal.gdc.cancer.gov  2. Build Cohort 상단 메뉴에서 Repository를 클릭한 후 CASES..